天津市中西医结合医院•南开医院始建于1947年，1997年经国家中医药管理局批准，南开医院增名“天津市中西医结合医院”，其坚守“中西合璧、日新月异、德高医粹、至仁至信”的院训，秉承“艰苦奋斗的创业精神、严谨求实的科学态度、竭诚服务的医疗作风，为发展中西医结合事业殚心竭力”的南医精神，以保障人民健康为中心，以推进新时代中西医结合临床医学中心建设为目标，推动中西医结合事业迈向新发展新阶段。
中西医结合治疗急腹症被确定为全国典型，并被世界卫生组织公布为中国在世界领先的五项医药学项目之一，医院成为我国第一个中西医结合临床示范基地。

吴咸中院士积极响应党中央号召，带领几代南医人艰苦奋斗，使医院在中西医结合治疗急腹症领域获得多项殊荣：1964年确定为全国首家中西医结合临床研究基地；1970年中西医结合治疗急腹症被确定为全国典型，成为第一个中西医结合临床示范基地；1974年，在天津市率先引进十二指肠镜诊疗和腹部超声技术，使急腹症治疗手段领先于国内，成为内镜外科发源地；1975年医院被批准举办成立天津市中西医结合急腹症研究所；1978年出版《新急腹症学》，使中西医结合急腹症治疗学形成完整体系并于同年被卫生部授予 “全国中西医结合研究红旗单位”称号；1982年中西医结合治疗急腹症被世界卫生组织公布为中国在世界领先的五项医药学项目之一；1995年天津市中西医结合研究院挂靠南开医院；2008年确定为全国首批重点中西医结合医院；2015年医院被确定为天津市中西医结合急腹症临床医学中心和天津市急腹症器官损伤与中西医修复重点实验室建设单位；2023年成为国家级中西医协同“旗舰”医院建设试点项目储备库。